Nos Departamentos da Faculdade de Medicina da UFC existem laboratórios específicos que atendem tanto ao ensino quanto a pesquisa. Entre eles citamos Laboratórios Morfofuncional, de Anatomia, de Microscopia, de Farmacologia e Fisiologia Humana, de Histologia, de Imunologia, Parasitologia, Patologia, Patologia Clínica, Necrópsia, Genética, Micologia, Virologia, Habilidades Clínica Cirúrgica, de Cirurgia Experimental, de Informática e outros.

Cada um dos laboratórios didáticos e de pesquisa especializados tem a sua especificidade com equipamentos apropriados e em bom estado de conservação. Os recursos humanos são adequados e capacitados de forma a prover o ensino de qualidade e a pesquisa.

Nos laboratórios dedicados à pesquisa existem equipamentos tecnológicos de ponta multiusuários.

Os laboratórios contam com pós-graduandos em atividades que desenvolvem projetos de mestrado e doutorado, elaborados com rígidos protocolos e em observância as normas de biossegurança.

Muitos dos laboratórios didáticos especializados atendem exclusivamente a clientela acadêmica, embora alguns como os de Patologia, Patologia Clínica e Necropsia tem forte inserção com o Complexo Hospitalar a quem prestam serviços comunidade.

Alguns laboratórios de pesquisa vinculado a Programas de Pós Graduação realizam procedimentos, testes diagnósticos e terapêuticos que atendem a uma clientela restrita. Parte da manutenção dos equipamentos, insumos e o suporte técnico a estes laboratórios provem dos Projetos de pesquisa financiados pelos docentes pesquisadores e com recursos provenientes da própria Universidade.